"Med den nuvarande covid-19-situationen kommer det att vara nödvändigt att minska riskerna för infektion genom att begränsa människors rörlighet", skriver arrangörerna i ett uttalande.
"Vi har därför beslutat att uppmana publiken att avstå från att följa loppen längs med banan."
De har haft samtal med lokala myndigheter och polisen för att diskutera herrarnas och damernas maratonlopp, samt gångtävlingarna.
Arrangörerna ska fortsätta föra dialog med lokala myndigheter för att "säkerställa ett tryggt och säkert OS för alla deltagare och för alla medborgare i Sapporo och Hokkaido".
Maratontävlingarna har sedan tidigare flyttats till Sapporo för att undvika hettan i Japans huvudstad Tokyo.
OS inleds den 21 juli.