Frida Karlsson gick ut hårt, och var snabbare än Therese Johaug på de första 1,2 kilometerna, men vid 3,1 kilometer var hon 16 sekunder efter norskan.
När Charlotte Kalla hade åkt 3,1 kilometer låg hon på nionde plats, 24 sekunder efter Therese Johaug.
Några kilometer senare var norskan, som startade en minut efter Charlotte Kalla, nästan ikapp henne i spåret.
Då Therese Johaug gick i mål var hon 30 sekunder före tvåan Krista Pärmäkoski, en minut och 10 sekunder före Frida Karlsson – som blev bästa svenska, och en minut och 22 sekunder före Charlotte Kalla.
Den senares tid, 28 minuter och 10 sekunder, räckte bara till en 17:e plats.
Hon fick också se sig besegrad av Jonna Sundling, som åkte de tio kilometerna på 28 minuter och en sekund.
Charlotte Kallas och Jonna Sundlings klubbkamrat Emma Ribom blev 28:a.
– Det kändes inget vidare i dag, sa en besviken Charlotte Kalla till SVT och tillade:
– Det här hade jag inte förväntat mig.