Segern var Kiruna Citys fjärde på de senaste fem matcherna.
Första perioden blev mållös. Det var först 6.44 in i andra perioden som Kiruna City tog ledningen genom Max Olofsson assisterad av Ivar Johnson och Andreas Kero.
Efter 6.39 i tredje perioden gjorde Kiruna City 2-0 genom Andreas Kero.
Isak Nordanståhl reducerade dock för Överkalix med bara två minuter kvar att spela och gav matchen liv igen.
Förlusten var Överkalix andra uddamålsförlust.
Överkalix har haft en tuff start på serien och är helt utan poäng efter fem spelade matcher. Kiruna City har tolv poäng.
Lagen har mötts två gånger tidigare under säsongen. Fram till den här matchen hade de tagit en seger var.
I nästa match möts lagen igen i Lombiahallen, söndag 26 januari 12.00.