Först i förlängningen kom avgörandet, där Boden spikade segerresultatet, 3-2 (0-1, 0-0, 2-1, 1-0).
Segern var Bodens sjunde på de senaste åtta matcherna.
Boden hade problem och låg under med 0-1 efter två perioder.
Målgörarna för Boden var Gustav Lager, Lukas Lundberg och Julian Möllerstrandh. Hugo Nordlander och Armands Sorokins gjorde Njurundas mål.
Det här var Bodens femte uddamålsseger den här säsongen.
För Boden gör resultatet att man nu ligger på tredje plats i tabellen, medan Njurunda är på sjunde plats.
Den 9 februari spelar lagen mot varandra på nytt, i Modin & Zetterberg Hallen.
Nästa motstånd för Boden är Sundsvall J20. Lagen möts lördag 8 februari 16.45 i Ungdomshallen.