Cunningham, som haft en trasslig vår på grund av skador, kan bli Piteås frälsare när det gäller att klara kontraktet i ettan till hösten.
Även om Piteå var snäppet bättre så saknade inte BBK chanser.
Oscar Stjernquist hade två bra möjligheter. Först en nick utanför i första halvlekens slutminut. Sedan ett bra läge även i andra halvlek.
– Jag nästan skäms över att jag inte gjorde mål. Men det kändes som om vi inte riktigt vågade spela ut, säger Stjernquist.
Om Piteå står inför en tuff höst så väntar en ännu tuffare uppgift för Boden: att hämta in Sandvikens eller Hudiksvalls försprång i tvåan.
– Visst känns det mentalt jobbigt. Ifall vi besegrat Hudiksvall hade gapet bara varit två poäng. Men även om vi ligger långt efter är det inte omöjligt och vi måste tro på det, säger Stjernquist.
Peter Gitselov hade också två bra lägen men Piteås seger var motiverad.
Piteå skapade en hel del i början och träffade både stolpe och ribba i samma anfall innan duktige James Burgin gjorde 0-1 med hjälp av en BBK-back.
Boden hade en bra period i början av andra halvlek innan Karl Cunningham avgjorde med sina två mål.
I finalen väntar Kiruna eller IFK Luleå som möts på onsdagen.