Nässjö tog ledningen redan efter drygt en minut spelad när Linus Nilsson satte 0–1.
Men sedan var det Kalix Bandy för hela slanten.
Hemmalaget skapade totalt 17 hörnor mot Nässjös fyra.
Men det dröjde till drygt 50 minuter innan Johan Sundqvist kvitterade till 1–1 på just hörna.
Sundqvist fullbordade sedan vändningen när han gjorde 2–1 på straff i 78:e minuten.
Mikael Jansson kunde sätta 3–1 på hörna i minut 84 och Nils Wikström kunde sedan fastställa slutresultatet till 4–1 på tilläggstid.
Segern innebär att Kalix Bandy nu har tre poäng i elitseriekvalet.
I första matchen lyckades man kvittera mot Falu BS Bandy med endast 27 sekunder kvar.