Midtjylland lottades som hemmalag.
Norska Molde får däremot resa långt. I Azerbajdzjan står Karabach mellan norrmännen och en plats i playoff-spelet till Champions Leagues gruppspel.
Andreas Linde och Mattias Moström är svenska spelare i Molde.
Ferencvaros, som slog ut Djurgården i första kvalomgången och sedan eliminerade Celtic, ställs mot Dinamo Zagreb i Budapest.
Lottningen i övrigt: Omonia Nicosia, Cypern–Röda Stjärnan, Serbien, Maccabi Tel Aviv, Israel–Dinamo Brest, Belarus, Paok Saloniki, Grekland–Benfica, Portugal, Dynamo Kiev, Ukraina–AZ Alkmaar, Nederländerna, Gent, Belgien–Rapid Wien, Österrike.
Matcherna spelas den 15 och 16 september.