22-åringen fick lämna Afghanistan i ett flygplan under fredagsmorgonen.
Sjukvårdspersonal fanns med på planet.
- Läget är fortfarande allvarligt men tillräckligt stabilt för att man kan transportera hem honom, sa Börje Sidenö, stabsläkare på Högkvarteret.
Elisabeth Tysk, presschef Akademiska sjukhuset i Uppsala, kunde bekräfta att Tärendöbon hade kommit till sjukhuset strax efter lunchtid.
- Just nu kan vi inte säga något om personens tillstånd. Han var nedsövd och ska undersökas på Centralintensiven, där de svårast och mest akut skadade ligger, säger Elisabeth Tysk.
Chefläkare Ulf Hanson har huvudansvaret för undersökningen av den 22-årige Tärendöbon.
Ytterligare ett plan är på väg till Afghanistan för att eventuellt kunna frakta hem den 30-årige Luleåbo som har svårast skador efter onsdagens bombattentat.
Mannen vårdas på det tyska fältsjukhuset där även svenska läkare finns på plats.
Det är fortfarande oklart när han kommer att kunna flygas hem.
- Han kommer inte att kunna flygas hem i dag, fredag, säger Johan Lundgren, informatör vid Försvarsmakten.
Samtidigt rapporterar Nyhetskanalen i TV 4 att de tyska helikoptrarna blev beskjutna i samband med räddningsinsatsen.
Det var orsaken till att evakueringen av svenskarna i Afghanistan fördröjdes.
Den svenske stabschefen Jerker Persson, vid svenska basen i Mazar-i-Sharif i Afghanistan och hemmahörande i Boden, uppger att en utredning får visa om några felaktigheter förekom vid hanteringen helikopterevakueringen.