Tsunamivågorna beräknas bli runt en meter höga, skriver japanska medier, enligt AFP. Reuters rapporterar att det inte ska vara någon risk för en utbredd tsunami i Stillahavsregionen.
Enligt de första uppgifterna ligger skalvets epicentrum nära det område där jordbävningen i mars 2011 inträffade. Det skalvet orsakade en förödande tsunami över Japan, då tiotusentals människor omkom och kärnkraftsverket i Fukushima ödelades.
USA:s geologiska institut (USGS) skriver ner skalvets storlek en aning, från 7,4 till 7,3.
Tsunamivarningen gäller kustområdena i prefekturen Miyagi i nordöstra Japan, vilket är den region som drabbades av tsunamin 2011, rapporterar Reuters.
Enligt det japanska etermediebolaget NHK har Japans meteorologiska institut utfärdat en mildare tsunamivarning för kusterna i prefekturerna Iwate, Fukushima, Aomori och Ibaraki.
Skalvet kändes ända bort till huvudstaden Tokyo, där byggnader sattes i svaj.