Vid mätstationen i Kalix noterades 06.00 på torsdagsmorgonen ett vattenstånd 115 centimeter under det normala.
Klass 2-varning utfärdas när vattenståndet är mer än 100 centimeter under medelvattenståndet då det finns risk för grundstötning och problem att angöra vissa hamnar.
Enligt prognoserna ska dock vattnet börja stiga under förmiddagen.
En klass 1-varning för nedisning är också utfärdad för Bottenviken. Det är risk för måttlig till svår nedisning.
Dagens väderprognos:
Kustområdet får till en början klart väder på många håll. Fram på dagen mulnar det på österifrån och från eftermiddagen kan det tidvis falla snö. Kylan dämpas något och temperaturen håller sig kring minus 15.
I inlandet blir det kallare, 20-30 minusgrader. I norr ökar molnigheten långsamt och kylan dämpas. Från i natt tidvis snöfall.