Det var på distansen fem kilometer fritt som medaljen kom. Henriksson var 27 sekunder bakom segrande Jonna Sundling från Umeå.
Hon dock turen med sig då bronsmedaljören Jackline Lockner, Graninge-Alliansen, endast var fem tiondelar bakom.
- Jag är nöjd. Fristil är mitt svagaste kort så jag kan inte vara besviken, säger Sofia Henriksson.
JSM fortsätter med en klassisk sprint, en dubbeljakt och en stafett.