Beslutet togs på kommunstyrelsens arbetsutskott på måndagen.
Investeringen för infrastrukturkorridoren i Boden är på 1,6 miljarder. Av det går kommunen in med nio procent och Polar Structure med 91 procent.
Bodens kommun har tagit fram ett speciellt upplägg för projektet med två kommunala bolag, som företaget tar över i och med att affären färdigställs. I ett senare skede ska en lösning för tekniskt vatten beslutas.
Bodens kommun står för marken, vilken enligt P4 Norrbotten har ett värde av 25 miljoner kronor.
Upphandlingen gjordes i maj.
Parallellt med järnvägsbygget kommer även uppförandet av vägar och broar för att tillgodose en säker och planskild lösning för gång- och cykeltrafik, skriver kommunen i ett pressmeddelande.
– Dagens beslut är en enorm milstolpe för hela Bodens utveckling. Och bäst av allt är att det är en fantastisk uppgörelse som kommer att kosta noll kronor av bodensarnas skattemedel. Det här är en riktigt, riktigt bra dag och jag vill särskilt lyfta fram våra tjänstepersoner som har gjort den här lösningen kring järnvägen möjlig, säger Claes Nordmark (S), kommunalråd.
– Den nyindustrialisering vi ser uppe i norr, inte minst i Boden är imponerande och viktig för Sverige. För att möjliggöra fortsatt utveckling och säkra ekonomisk tillväxt, inte bara i Boden utan på många andra platser i Sverige, krävs uppgradering av kritisk infrastruktur, såsom järnväg, säger Tobias Emanuelsson, vd Polar Structure