Tokyobörsens Nikkei 225-index föll 1 procent, medan det bredare Topix-index gick ned 0,9 procent.
Marknaden präglas bland annat av oro för ökad smittspridning i pandemin inför OS i Tokyo.
Seoulbörsen hängde på nedåt och backade 0,6 procent, medan Taiwanbörsen stängde på en nedgång på 0,4 procent.
Shanghaibörsen låg på plus 0,6 procent i den avslutande handeln med elbilstillverkare som draglok. Hongkongbörsen hängde dock på övriga stora asiatiska börser nedåt, med en nedgång på minus 0,9 procent i den avslutande handeln.