Larmet om olyckan inkom vid klockan 16.47 på tisdag eftermiddag.
Enligt polisens initiala uppgifter hade mannen kört in i en vajer i höjd med färjeleden i Rödupp, en dryg mil norr om Överkalix.
– Den lilla information vi har fått är att en person har fått tas upp i en båt, på västra sidan av älven, sa Robert Larsson, insatsledare inom räddningstjänsten i Överkalix, vid 17-tiden.
Räddningstjänst, ambulans och polispatrull skickades till olycksplatsen och räddningsarbetet pågick för fullt vid 17.30-tiden.
– Han har fått allvarliga skador, sa Stefan Fredriksson, polisbefäl vid regionledningscentralen i Umeå, vid klockan 17.45.
Vid 19-tiden gick polisen ut med information om att mannen hade avlidit av de skador som han ådrog sig vid kollisionen med vajern.
Anhöriga är underrättade.
Olyckan kommer nu att utredas vidare av polisen i Överkalix och vattenskotern är tagen i beslag för teknisk undersökning.
I skrivande stund är det okänt om det fanns några vittnen till olyckan eller om mannen tillhörde ett sällskap med flera vattenskotrar.
– Det är jätteviktigt för oss att leta rätt på vittnen, säger Stefan Fredriksson, RLC-befäl hos polisen i Umeå.
NSD:s medarbetare Maria Engström-Andersson anlände till olycksplatsen vid klockan 18.30 på tisdag kväll och då fanns inte längre räddningspådraget kvar.
– Färjan är igång men det finns inga personer med anknytning till olyckan kvar, säger Maria Engström-Andersson.
Färjans personal ville inte uttala sig om olyckan.
Röduppleden, Trafikverkets nordligaste färjeled, dras framåt med hjälp av en kraftig vajer som löper i luften.
– Vajern sträcks när färjan åker över älven, säger Maria Engström-Andersson.
Trafiken med vattenskotrar har enligt NSD:s medarbetare ökat kraftigt i Kalixälven det senaste året.
– Det har varit fler vattenskotrar än någonsin på älven. Det har pratats mycket om det, säger Maria Engström-Andersson.
Olyckan inträffade när båten stod i hamn på den västra sidan av älven, enligt Agneta Eklund, pressinformatör på Trafikverket.
Hur kunde skoterföraren köra in i vajern?
– Linan går ovanför vattenytan och den är spänd när båten ligger i hamn. På båtens sidor står det utmärkt "linfärja". Men jag har aldrig varit däruppe så jag kan tyvärr inte ge mer information i dag, säger Agneta Eklund på Trafikverket vid 19-tiden.
Trots den tragiska dödsolyckan fortsatte färjetrafiken att gå under tisdag kväll.
Maria Engström-Andersson, NSD:s medarbetare, får kontakt med en ortsbo som var med vid räddningsinsatsen.
– Han var med och plockade upp mannen. Enligt ortsbon måste detta bli en polisssak gentemot rederi och Trafikverket, eftersom det inte finns något som varnar för vajern i luften. Han anser att färjevajern borde vara färgad eller åtminstone borde det finnas bojar ute på älven som varnar för den, säger Maria Engström-Andersson.
Mannen som omkom var från trakten, far till två barn och, enligt den ortsbo som NSD pratar med, van vid att färdas längs älven.
För närvarande råder högt vattenstånd i Kalixälven, vilket bidrar till att avståndet mellan färjevajern och vattenytan är mycket kortare – lägre – än normalt.