Anledningen är bland annat att sju sjöar i ett Natura 2000-område i anslutning till Piteälven riskerar att torrläggas. Det handlar bland annat om Lill-Laver, Stor-Laver och Vistbäcken.
– Vi ser en risk för påtaglig skada av riksintresset Natura 2000, säger Anna Modig, assessor vid länsstyrelsen, till PT.
Länsstyrelsen menar vidare att gruvplanerna inte går att förena med riksintresset för rennäring. Samebyn SemisjaurNjarg har vinterbete i det planerade området.
Länsstyrelsens yttrande är ett obligatoriskt remissförfarande innan Bergsstaten fattar beslut om bearbetningskoncession.
Bergsstaten kan välja att lämna ärendet vidare till regeringen.
Den planerade koppargruvan i Laver kan ge 600 jobb och det dubbla i bieffekter till Älvsby kommun enligt tidigare uppgifter.
Pär Jonsson, näringslivschef i Älvsby kommun, säger att beskedet var väntat.
– Det har mer handlat om vad länsstyrelsen skulle peka på. Det är bara vänta och se vad Bergsstaten gör och så får vi ta det med Boliden. Vi tror att det blir en gruva i Laver. Däremot kan man diskutera tidsaxeln och hur lång tid det kommer att ta, säger Pär Jonsson till PT.